В результате он всё же рекомендовал согласиться на предложенные Советским Союзом условия мира, и начал энергично укреплять новую восточную границу.Поскольку мировая война ещё продолжалась, Маннергейм после окончания Зимней войны остался главнокомандующим, хотя этот пост в мирное время должен был занимать президент. Связным главнокомандующего при правительстве был промышленник, генерал Рудольф Вальден. После окончания Зимней войны он стал министром обороны.

После зимней войны уважение к Маннергейму в мире выросло. Иностранные государства, в том числе, например, Германия, искали контактов с ним для решения политических вопросов. Во время Войны-продолжения армия Финляндии захватила территории, утраченные ею по условиям заключённого после Зимней войны мира, а также и часть Советской Карелии. Начиная наступательную войну, Маннергейм десятого июля 1941 года направил в свои войска знаменитый приказ "о ножнах".

Из своего Главного штаба Маннергейм вёл войну в соответствии с ресурсами маленькой страны, осторожно. Впоследствии ему выражалась благодарность за то, что финская армия не двинулась на Ленинград и не была перерезана Мурманская дорога. Но его обвиняли в том, что Англия, в ответ на продолжение Финляндией наступления за пределы её старых границ, шестого декабря 1941 года объявила ей войну.

Маннергейм остерегался давать политические советы правительству, но несмотря на это его мнение оказывало влияние и на принятие внешнеполитических решений. Формально же ответственность лежала на гражданском руководстве. Конечно, авторитет Маннергейма был столь велик, что он мог бы задать тогдашней политике  Финляндии совсем иную ориентацию, и поэтому на нём лежала огромная ответственность за принятые в то время решения.